Untuk mencapai tujuan organisasi, Pengurus Pusat dapat membentuk Badan Otonom yang kegiatannya meliputi:
| BADAN PENDIDIKAN DAN LATIHAN | |
| KETUA | HADI SISWANTO, Dr, MPH |
| ANGGOTA | AGUS WIBOWO, SE, MBA |
| HENDRO SUKARNO, Drs | |
| HERONIMUS ABI, SH. | |
| AKBAR YUMNI | |
| RAHMAD HANDOYO, S.Pi, MM | |
| BADAN USAHA DAN BISNIS | |
| KETUA | DENNY H. ISKANDAR,SE,Eng,MBA, MSc |
| ANGGOTA | EFFENDI SIANIPAR, Ir |
| MUJIONO, Ir, MM | |
| YULIANTO W. RAHARDJO, SE, MSi. | |
| FERDI SERIANG, SE | |
| SRI WURYANI | |
| AFNI SALMI, SIP, MBA | |
| LEMBAGA BANTUAN HUKUM | |
| KETUA | ABDULLAH SUBUR, S.H. |
| ANGGOTA | FIDELIS GIAWA, S.H. |
| SAIFUL MAARIF, S.H. | |
| SUDIYATMIKO ARIBOWO, S.H. | |
| HERY WAHYUDIONO, S.H. | |
| BADAN LINGKUNGAN HIDUP | |
| KETUA | JACOB BOBO, Drs |
| ANGGOTA | RAHAYU HANDONOWATI, Dra |
| MITSU PARDEDE, S.Sos | |
| HERI PURNOMO, | |
| PAMUNGKAS AYUDHANING D, SIP | |
| AGUS WIRYONO, SPd | |
| RISET DAN ILMU PENGETAHUAN | |
| KETUA | HENDRASMO,M.A. |
| ANGGOTA | SUHAWI,ST |
| SUWALIJO | |
| DENY WICAKSONO | |
| AGUS F ISMAIL | |
| YUFY VIRDA,S.E. | |
| BADAN PENGENDALIAN DAN BANTUAN BENCANA | |
| KETUA | DWI PUTRO ARIESWIBOWO, SH. |
| ANGGOTA | YOS DAPA BILLY, S.Sos |
| GRENGSENG PAMUDJI, SPT | |
| SLAMET, S.Sos | |
| KAREL RIDOLOF LABOK, ST. | |
| SILVESTER MBETE | |
| LEMBAGA PENGUATAN KAPASITAS PENYELENGGARAAN PEMERINTAHAN | |
| KETUA | AGUSTIANI SITORUS, S.E. |
| ANGGOTA | PRAMAARTHA LAPODE, SIP, M.Si |
| KARYONO | |
| TEJA KUSUMA, SIP | |
| GALIH PRATIDINA MAHARSIWI, S.E. | |
| GUNTUR DEWANTO, SaP | |
| LEMBAGA PENINGKATAN KAPASITAS KADER | |
| KETUA | TITO SUHENDRO, Drs |
| ANGGOTA | JUN PRIMAWAN |
| SUGENG PRASTOWO | |
| SIGIT WIDIARTO,SIP | |
| SYAIFUL BACHRIE,S.Sos | |
| YERRY GOHI,S.E. | |
| LEMBAGA PERS DAN PENERBITAN | |
| KETUA | JEFRI RAWIS, Drs. |
| ANGGOTA | SONNY V TULUNG, Drs. |
| THEO YUSUF, SH, M.H. | |
| ANDUS SIMBOLON | |
| WANTO SUGITO, SH. | |
| EKA AVIA RAHMAN, SE. | |